Avans Hogeschool — ATLS ↗

Analysetools

Interactieve tools van lectoraat analysetechnieken in de life sciences. Selecteer een tool uit het overzicht hieronder.

tools

Dash · Python TaxStax Reproducerbaare en mooie visualisaties van taxonomische relative abundance data. ↗ HTML · JavaScript ProtPepCov Visualiseer de coverage van een eiwitsequentie met een lijst van gemeten peptides. ↗ Dash · Python TapeScope Een dashboard om TapeStation matrices te visualiseren. ↗ Shiny · R MetEx Verken verschillende ordinaties van MS data in een interactive omgeving. ↗ Flask · Python EquiPoolTool Bereken volumes voor equimolair poolen op basis van concentraties, voor ONT sequencing library prep. ↗ HTML · JavaScript DNA Dilution calculator Bereken de benodigde volumes voor het verdunnen van DNA. ↗

docs

README TaxStax Documentatie en broncode van de tool. Ontwikkelaar: Birgit Rijvers-van Pruissen. ↗ README ProtPepCov Documentatie en broncode van de tool. Ontwikkelaar: Birgit Rijvers-van Pruissen. ↗ README TapeScope Documentatie en broncode van de tool. Ontwikkelaar: Sander Boden. ↗ README MetEx Documentatie en broncode van de tool. Ontwikkelaar: Banu Keikina. ↗ README EquiPoolTool Documentatie en broncode van de tool. Ontwikkelaar: Birgit Rijvers-van Pruissen. ↗ README DNA Dilution calculator Bereken de benodigde volumes voor het verdunnen van DNA. Ontwikkelaar: Birgit Rijvers-van Pruissen. ↗

team

Bijdragers

Birgit Rijvers-van Pruissen Bioinformaticus Nerd

Sander Boden Bioinformaticus Nerd

Banu Keikina Stagiair MSc student